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「Desktop フローを実行」アクションを用いているとのことなので、メインフロー、サブフローはそれぞれ親フロー、子フローのことだとして回答します。
（PADでは通常メインフロー、サブフローと言うと同じDesktopフロー内のタブで分けられたフローのことを指します）親フローでもOutlookの処理が必要で、且つ、子フローに分けないと駄目な理由があるなら今の処理方法で問題ないと思いますが、そうでないなら、Desktopフローを統一するか、親フローのインスタンス生成は無くして、閉じるアクションは子フローに入れるのが良いかと思います。