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こんにちは。
過去Verを復旧できるよう、ソリューションを使用した運用しているのでコメントしました。狙った回答ではないかもしれませんが、参考までに。
フロー出力方法：
ソリューションエクスポート形式（デスクトップフローのみ） → zipファイルを社内共有フォルダに保管
運用法保：
・通常時 ：過去2世代分は必ずPADの環境に残す
・2世代以上前：ソリューションとしてエクスポートし、不要なフローとして環境内から削除
・必要に応じて：別の環境に汎用的なフローを作成しておき、ユーザーから要望があったフローをエクスポート・利用環境にインポート
PADのバージョンが離れすぎるとソリューションのインポートができないことがあったため、2世代まではPAD内から削除せず腹持ちするようにしています。
腹持ちにしてあれば、PADをバージョンアップしても対象フローが開けるため、フローを開いてそのまま上書き保存で最新VerのPADでも利用できます。
なお、クラウドフローに関しては今のところそのような運用をしていないので記載を省きます。